¿Cómo funcionan las pruebas genotípicas
Los medicamentos actuales contra el VIH atacan uno o dos genes o proteínas vitales del VIH. Estos son la transcriptasa reversa (TR o transcriptasa inversa) y la proteasa. Las pruebas genotípicas buscan mutaciones en los genes para los blancos de estos medicamentos. Las mutaciones en algunas posiciones dentro de los genes han sido vinculadas con la resistencia a los medicamentos. Por ejemplo, una mutación en la posición 30 del gene de la proteasa resulta en una resistencia al nelfinavir. (Ver Tabla 1.)
Tabla 1: Mutaciones de la proteasa
|
| Medicamento |
posición del medicamento en el gene, proteasa |
| 20 |
30 |
36 |
46 |
48 |
50 |
54 |
63 |
71 |
82 |
84 |
88 |
90 |
101 |
| Amprenavir |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Indinavir |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Nelfinavir |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Ritonavir |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Saquinavir |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| |
Mutaciones mayores: claramente asociadas con resistencia al medicamento. |
| |
Mutaciones menores: añaden a la resistencia causada por las
mutaciones mayores. |
| |
Variantes naturales: variantes naturales del virus que pueden agregar
a la resistencia a los medicamentos. |
Advertisement
Tabla 2: Mutaciónes de la transcriptasa reversa
|
Medica- mento |
posición del medicamento en el gene, transcriptasa reversa |
| 41 |
65 |
67 |
70 |
74 |
75 |
103 |
115 |
116 |
151 |
181 |
184 |
188 |
210 |
215 |
219 |
333 |
| 3TC |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Abacavir |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| AZT |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| AZT + ddI/ddC |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| AZT + 3TC |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| d4T |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| ddI / ddC |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Delavirdina |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Efavirenz |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Nevirapina |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Adefovir |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| |
Mutaciones mayores: claramente asociadas con resistencia al medicamento. |
| |
Mutaciones menores: añaden a la resistencia causada por las mutaciones mayores. |
Pruebas genotípicas: ¿cómo se hacen?
La manera más común de realizar las pruebas genotípicas es usando una máquina que lee la secuencia de los genes de la proteasa y la TR. Los resultados se comparan con una secuencia de genes del VIH original, o no mutada. Cualquier mutaciónse coteja con una lista de cambios que se sabe que producen resistencia a los medicamentos.
La mayoría de los medicamentos sigue un patrón fijo de mutaciones resistentes. Sin embargo, esta prueba es menos eficaz para predecir la resistencia a los inhibidores de proteasa (IP) que poseen mutaciones más variadas. Además sólo detecta mutaciones que conforman entre el 20 y el 50% del total de la población viral, de manera que no reconocerá niveles muy bajos de virus resistentes.
Una segunda técnica, llamada line probe assay o "Lipa," por sus siglas en inglés, utiliza una prueba específica (es decir que examina mutaciones específicas) para detectar mutaciones resistentes. Puede detectar las mutaciones que conforman apenas entre el 2 y el 5% del total de la población de virus.
Un tercer método, llamado GeneChip, utiliza un chip que tiene integrados numerosos marcadores. Una muestra de sangre se coloca en el chip y se pasa a través del escáner. Los resultados se compilan por medio de un computador que muestra cualquier mutación en los genes.
Parece ser que la precisión de los resultados no difiere entre los distintos tipos de pruebas. Es más importante que el laboratorio tenga un buen control de calidad y un personal cualificado.
|
Pruebas genotípicas: ¿Qué significan los resultados?
Los resultados de las pruebas genotípicas listan las mutacionesencontradas en los genes de la proteasa y la TR del VIH de una persona.Por lo general indican lo que esto significa en términos de resistenciaa los medicamentos. Las tablas 1 y 2 en la página 2 muestra lasmutaciones conocidas que presentan resistencia a los medicamentos actualescontra el VIH. El reporte de una prueba genotípica puede ser difícilde comprender. Es posible que la persona y el médico deban consultara un especialista que sepa cómo leer e interpretar los resultados.
Pruebas genotípicas: Las ventajas y desventajas
La Tabla 3 lista ventajas y desventajas de las pruebas genotípicas. Esta prueba es más barata y mucho más rápida que la prueba fenotípica pero de todos modos cuesta entre $300 y $600. Los resultados por lo general se obtienen al cabo de una semana.
Un problema importante de las pruebas genotípicas es que no distingue las mutaciones no conocidas de los genes. Una mutación que no cause resistencia por si sola, podría conllevar resistencia cuando se combina con otras mutaciones. Un ejemplo es que la resistencia al 3TC reduce la resistencia al AZT.
Tabla 3: Pruebas genotípicas: ventajas y desventajas |
| Ventajas |
Desventajas |
| Prueba menos compleja |
Puede ser menos útil para la resistencia
a los inhibidores de proteasa |
| Es menos costosa |
Podría necesitar interpretación
por un experto |
| Más amplia disponibilidad |
La mayoría no puede detectar las
especies menores |
| Funciona con carga viral
más baja |
Vínculos entre los genes y la
resistencia no se conocen plenamente |
| Resultado más rápidos |
Varía la cualidad de los laboratorios |
| |
Se debe estar en terapia contra el VIH |